渔业生态养殖是一种可持续发展的渔业生产方式，以生产绿色水产品和无公害水产品为特色，在传统养殖、加工和运销等生产实践经验的基础上，结合现代渔业科技而建立起来的一种多层次、多结构、多功能的渔业经济模式，是水产养殖发展与环境保护“双赢”的可持续发展方法。近年来，水域污染、渔业资源衰退和渔业食品安全等问题困扰水产养殖业的健康发展。为此，泉州市积极推进渔业生态健康养殖，并大力加以扶持。
在泉州市公布的《关于扶持和促进现代渔业健康持续发展的实施意见》中，泉州市大力发展设施渔业，扶持规模成片池塘配套升级、陆上工厂化循环水养殖、浅海环保型塑胶养殖网箱等现代渔业设施建设，并在今年年内增加标准化池塘改造2000亩；新增工厂化养殖设施2万平方米，新增国家级健康养殖示范基地、“菜篮子基地”5个。具体扶持包括：连片规模20亩以上淡水养殖池塘、30亩以上海水养殖池塘配套设施升级，每亩补助1000元，新建、改建5亩以上高水位精养池的，新建池每亩补助5000元，改建池每亩补助3000元；新建或扩改建工厂化养殖场水面面积1000平方米以上，并具有循环水处理设施或设备的，按其建设的实际养殖水面，新建工厂化养殖池面积，高可给予40万元补助；更新改造浅海环保型塑胶养殖网箱，网箱规格在2.4m*2.4m以上的，每口补助1000元。
此外，在水产苗种方面，泉州市加强水产养殖新品种开发、良种选育和苗种繁育等建设，逐步实现良种培育标准化，苗种生产规范化和产业化。具体扶持标准有：对新建或扩改建淡水池塘育苗场，池塘面积30亩以上，配套设施完整的，新建场给予30万元补助，扩改建场给予20万元补助；对新认定为省级良种场的，每个场补助20万元，对新认定为市级良种场的，每个场补助10万元。
